Régulation de l’expression génique et cancer
Régulation de l’expression génique et cancer
Depuis 30 ans, nous étudions les bases moléculaires de la régulation de l'expression des gènes. Le groupe a travaillé pendant plus de 25 ans sur la structure et la fonction du facteur de transcription général TFIID des mammifères, de sa sous-unité TBP (TATA-binding protein TBP) ainsi que des paralogues exprimés dans les cellules germinales mâles du composant TFIID tels que TBP-related factor 2 (TRF2) ou TAF7L, publiant plus de 50 articles sur ces sujets.
En 2008, l'objectif principal du groupe est passé de l'étude du facteur de transcription général TFIID à l'étude de la régulation de l'expression des gènes et de l'épigénétique dans le mélanome malin. Nous avons d'abord concentré notre attention sur le rôle des facteurs de transcription MITF et SOX10 dans la prolifération des cellules de mélanome, en identifiant leurs gènes cibles, y compris les longs ARN non codants (lncRNA) qui sont maintenant au centre de l'attention, et en utilisant la spectrométrie de masse pour identifier leurs cofacteurs potentiels. Parmi les cofacteurs de MITF et SOX10 que nous avons identifiés figurent les complexes de remodelage de la chromatine SWI/SNF, NuRF et NuRD. Nous avons défini le rôle de BRG1, la sous-unité ATPase du complexe SWI/SNF PBAF, dans les cellules de mélanome humain en culture en montrant comment il est recruté par MITF et/ou SOX10 aux éléments cis-régulateurs conduisant l'expression des gènes impliqués dans la prolifération des cellules de mélanome. Nous avons défini le rôle de la sous-unité d'échafaudage BPTF de NuRF dans les cellules de mélanome humain en culture et dans la lignée des mélanocytes de souris in vivo où nous avons identifié son rôle critique dans la réactivation du programme d'expression génique des mélanocytes dans les cellules souches mélanocytaires adultes pendant la phase anagène. Nous avons également défini les rôles critiques de BRG1 et BPTF en tant que cofacteurs de MITF et SOX10 dans le mélanome de souris in vivo. L'étude du rôle de la sous-unité ATPase CHD4 du complexe NuRD nous a conduit dans le domaine du métabolisme des cellules cancéreuses. Nous avons défini un nouveau mécanisme par lequel la citrullination de l'enzyme glycolytique clé PKM2 régule la glycolyse et la prolifération cellulaire dans une variété de cellules cancéreuses.
Une liste complete de publications se trouve ici: https://orcid.org/0000-0001-5533-1171
Membres
Chercheur(euse)s
Doctorant(e)s
Ingénieur(eure)s
Actualités
Mélanome : identification d’un gène indispensable à la croissance tumorale
Le mélanome est un cancer caractérisé par une dangerosité accrue en raison de sa croissance rapide et de sa propension à métastaser. Dans un article…
Lire la suite
Publications
-
2017
-
Macrophage production and activation are dependent on TRIM33
- Anne-Sophie Gallouet
- Federica Ferri
- Vanessa Petit
- Aude Parcelier
- Daniel Lewandowski
- Nathalie Gault
- Vilma Barroca
- Stéphanie Le Gras
- Eric Soler
- Frank Grosveld
- Irwin Davidson
- Paul-Henri Romeo
Oncotarget ; Volume: 8 ; Page: 5111-5122
-
Improved Protocol for Chromatin Immunoprecipitation from Mouse Skeletal Muscle
- Shilpy Joshi
- Vanessa Pitiot
- Daniel Metzger
- Irwin Davidson
Journal of visualized experiments : JoVE
-
MITF-high and MITF-low cells and a novel subpopulation expressing genes of both cell states contribute to intra and inter-tumoral heterogeneity of primary melanoma
- Marie Ennen
- Céline Keime
- Giovanni Gambi
- Alice Kieny
- Sebastien Coassolo
- Christelle Thibault-Carpentier
- Fanny Margerin-Schaller
- Guillaume Davidson
- Constance Vagne
- Dan Lipsker
- Irwin Davidson
Clinical Cancer Research
-
-
2016
-
TRF2 is recruited to the pre-initiation complex as a testis-specific subunit of TFIIA/ALF to promote haploid cell gene expression
- Igor Martianov
- Amandine Velt
- Guillaume Davidson
- Mohamed-Amin Choukrallah
- Irwin Davidson
Scientific Reports ; Volume: 6
-
Retinoic acid instructs spermatogonia cell-fate through controlling expression of the SALL4A transcription factor
- Aurore Gely-Pernot
- Mathilde Raverdeau
- Marius Teletin
- Nadege Vernet
- Betty Féret
- Muriel Klopfenstein
- Christine Dennefeld
- Irwin Davidson
- Gerard Benoit
- Manuel Mark
- Norbert B Ghyselinck
-
Essential role of the TFIID subunit TAF4 in murine embryogenesis and embryonic stem cell differentiation
- Diana Langer
- Igor Martianov
- Daniil Alpern
- Muriel Rhinn
- Céline Keime
- Pascal Dolle
- Gabrielle Mengus
- Irwin Davidson
Nature Communications ; Volume: 7
-
T-cell-intrinsic Tif1alpha/Trim24 regulates IL-1R expression on TH2 cells and TH2 cell-mediated airway allergy
- Jimena Perez-Lloret
- Isobel S. Okoye
- Riccardo Guidi
- Yashaswini Kannan
- Stephanie M. Coomes
- Stephanie Czieso
- Gabrielle Mengus
- Irwin Davidson
- Mark S. Wilson
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America ; Volume: 113
-
-
2015
-
TRIM33 switches off Ifnb1 gene transcription during the late phase of macrophage activation
- Federica Ferri
- Aude Parcelier
- Vanessa Petit
- Anne-Sophie Gallouët
- Daniel Lewandowski
- Marion Dalloz
- Anita van den Heuvel
- Petros Kolovos
- Eric Soler
- Mario Leonardo Squadrito
- Michele de Palma
- Irwin Davidson
- Germain Rousselet
- Paul-Henri Romeo
Nature Communications ; Volume: 6
-
Chromatin-Remodelling Complex NURF Is Essential for Differentiation of Adult Melanocyte Stem Cells
- Dana Koludrovic
- Patrick Laurette
- Thomas Strub
- Céline Keime
- Madeleine Le Coz
- Sebastien Coassolo
- Gabrielle Mengus
- Lionel Larue
- Irwin Davidson
PLoS Genetics ; Volume: 11 ; Page: e1005555
-
A Brn2–Zic1 axis specifies the neuronal fate of retinoic-acid-treated embryonic stem cells
- Sylvia Urban
- Dominique Kobi
- Marie Ennen
- Diana Langer
- Stéphanie Le Gras
- Tao Ye
- Irwin Davidson
Journal of Cell Science ; Volume: 128 ; Page: 2303-2318
-
Page 4 sur 11