Régulation de l’expression génique et cancer
Régulation de l’expression génique et cancer
Depuis 30 ans, nous étudions les bases moléculaires de la régulation de l'expression des gènes. Le groupe a travaillé pendant plus de 25 ans sur la structure et la fonction du facteur de transcription général TFIID des mammifères, de sa sous-unité TBP (TATA-binding protein TBP) ainsi que des paralogues exprimés dans les cellules germinales mâles du composant TFIID tels que TBP-related factor 2 (TRF2) ou TAF7L, publiant plus de 50 articles sur ces sujets.
En 2008, l'objectif principal du groupe est passé de l'étude du facteur de transcription général TFIID à l'étude de la régulation de l'expression des gènes et de l'épigénétique dans le mélanome malin. Nous avons d'abord concentré notre attention sur le rôle des facteurs de transcription MITF et SOX10 dans la prolifération des cellules de mélanome, en identifiant leurs gènes cibles, y compris les longs ARN non codants (lncRNA) qui sont maintenant au centre de l'attention, et en utilisant la spectrométrie de masse pour identifier leurs cofacteurs potentiels. Parmi les cofacteurs de MITF et SOX10 que nous avons identifiés figurent les complexes de remodelage de la chromatine SWI/SNF, NuRF et NuRD. Nous avons défini le rôle de BRG1, la sous-unité ATPase du complexe SWI/SNF PBAF, dans les cellules de mélanome humain en culture en montrant comment il est recruté par MITF et/ou SOX10 aux éléments cis-régulateurs conduisant l'expression des gènes impliqués dans la prolifération des cellules de mélanome. Nous avons défini le rôle de la sous-unité d'échafaudage BPTF de NuRF dans les cellules de mélanome humain en culture et dans la lignée des mélanocytes de souris in vivo où nous avons identifié son rôle critique dans la réactivation du programme d'expression génique des mélanocytes dans les cellules souches mélanocytaires adultes pendant la phase anagène. Nous avons également défini les rôles critiques de BRG1 et BPTF en tant que cofacteurs de MITF et SOX10 dans le mélanome de souris in vivo. L'étude du rôle de la sous-unité ATPase CHD4 du complexe NuRD nous a conduit dans le domaine du métabolisme des cellules cancéreuses. Nous avons défini un nouveau mécanisme par lequel la citrullination de l'enzyme glycolytique clé PKM2 régule la glycolyse et la prolifération cellulaire dans une variété de cellules cancéreuses.
Une liste complete de publications se trouve ici: https://orcid.org/0000-0001-5533-1171
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Actualités
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Le mélanome est un cancer caractérisé par une dangerosité accrue en raison de sa croissance rapide et de sa propension à métastaser. Dans un article…
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Publications
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2012
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Retinoic acid induces Sertoli cell paracrine signals for spermatogonia differentiation but cell autonomously drives spermatocyte meiosis.
- Mathilde Raverdeau
- Aurore Gely-Pernot
- Betty Féret
- Christine Dennefeld
- Gérard Benoit
- Irwin Davidson
- Pierre Chambon
- Manuel Mark
- Norbert B Ghyselinck
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America ; Volume: 109 ; Page: 16582-7
-
Retinoic acid receptors recognise the mouse genome through binding elements with diverse spacing and topology.
- Emmanuel Moutier
- Tao Ye
- Mohamed-Amin Choukrallah
- Sylvia Urban
- Judit Osz
- Amandine Chatagnon
- Laurence Delacroix
- Diana Langer
- Natacha Rochel
- Dino Moras
- Gerard Benoit
- Irwin Davidson
Journal of Biological Chemistry ; Page: epub ahead of print
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Cdx2 determines the fate of postnatal intestinal endoderm
- Emma Stringer
- Isabelle Duluc
- Thoueiba Saandi
- Irwin Davidson
- Monika Bialecka
- Toshiro Sato
- Nick Barker
- Hans Clevers
- Catrin Pritchard
- Doug Winton
- Nicholas Wright
- Jean-Noël Freund
- Jacqueline Deschamps
- Felix Beck
Development (Cambridge, England) ; Volume: 139 ; Page: 465-474
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2011
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seqMINER: an integrated ChIP-seq data interpretation platform
- Tao Ye
- Arnaud Krebs
- Mohamed-Amin Choukrallah
- Celine Keime
- Frederic Plewniak
- Irwin Davidson
- Laszlo Tora
Nucleic Acids Research ; Volume: 39 ; Page: e35-e35
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2010
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TAF4b and Jun/Activating Protein-1 Collaborate to Regulate the Expression of Integrin α6 and Cancer Cell Migration Properties
- Margarita Kalogeropoulou
- Angeliki Voulgari
- Vassiliki Kostourou
- Raphael Sandaltzopoulos
- Rivka Dikstein
- Irwin Davidson
- Laszlo Tora
- Alexander Pintzas
Molecular Cancer Research ; Volume: 8 ; Page: 554-568
-
Cell-specific occupancy of an extended repertoire of CREM and CREB binding loci in male germ cells.
- Igor Martianov
- Mohamed-Amin Choukrallah
- Arnaud Krebs
- Tao Ye
- Stephanie Legras
- Erikjan Rijkers
- Wilfred van Ijcken
- Bernard Jost
- Paolo Sassone-Corsi
- Irwin Davidson
BMC Genomics ; Volume: 11 ; Page: 530
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Genome-wide analysis of POU3F2/BRN2 promoter occupancy in human melanoma cells reveals Kitl as a novel regulated target gene
- Dominique Kobi
- Anne-Lise Steunou
- Doulaye Dembélé
- Stéphanie Le Gras
- Lionel Larue
- Laurence Nieto
- Irwin Davidson
Pigment Cell & Melanoma research ; Volume: 23 ; Page: 404-418
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2009
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TAF4/4b x TAF12 displays a unique mode of DNA binding and is required for core promoter function of a subset of genes
- Kfir Gazit
- Sandra Moshonov
- Rofa Elfakess
- Michal Sharon
- Gabrielle Mengus
- Irwin Davidson
- Rivka Dikstein
Journal of Biological Chemistry ; Volume: 284 ; Page: 26286-26296
-
Recent advances in understanding the structure and function of general transcription factor TFIID.
- Emilie Cler
- Gabor Papai
- Patrick Schultz
- Irwin Davidson
Cellular and Molecular Life Sciences ; Volume: 66 ; Page: 2123-34
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HMGB4, a Novel Member of the HMGB Family, Is Preferentially Expressed in the Mouse Testis and Localizes to the Basal Pole of Elongating Spermatids.
- Raffaella Catena
- Emmanuelle Escoffier
- Cécile Caron
- Saadi Khochbin
- Igor Martianov
- Irwin Davidson
Biology of Reproduction ; Volume: 80 ; Page: 358-66
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