Régulation de l’expression génique et cancer
Régulation de l’expression génique et cancer
Depuis 30 ans, nous étudions les bases moléculaires de la régulation de l'expression des gènes. Le groupe a travaillé pendant plus de 25 ans sur la structure et la fonction du facteur de transcription général TFIID des mammifères, de sa sous-unité TBP (TATA-binding protein TBP) ainsi que des paralogues exprimés dans les cellules germinales mâles du composant TFIID tels que TBP-related factor 2 (TRF2) ou TAF7L, publiant plus de 50 articles sur ces sujets.
En 2008, l'objectif principal du groupe est passé de l'étude du facteur de transcription général TFIID à l'étude de la régulation de l'expression des gènes et de l'épigénétique dans le mélanome malin. Nous avons d'abord concentré notre attention sur le rôle des facteurs de transcription MITF et SOX10 dans la prolifération des cellules de mélanome, en identifiant leurs gènes cibles, y compris les longs ARN non codants (lncRNA) qui sont maintenant au centre de l'attention, et en utilisant la spectrométrie de masse pour identifier leurs cofacteurs potentiels. Parmi les cofacteurs de MITF et SOX10 que nous avons identifiés figurent les complexes de remodelage de la chromatine SWI/SNF, NuRF et NuRD. Nous avons défini le rôle de BRG1, la sous-unité ATPase du complexe SWI/SNF PBAF, dans les cellules de mélanome humain en culture en montrant comment il est recruté par MITF et/ou SOX10 aux éléments cis-régulateurs conduisant l'expression des gènes impliqués dans la prolifération des cellules de mélanome. Nous avons défini le rôle de la sous-unité d'échafaudage BPTF de NuRF dans les cellules de mélanome humain en culture et dans la lignée des mélanocytes de souris in vivo où nous avons identifié son rôle critique dans la réactivation du programme d'expression génique des mélanocytes dans les cellules souches mélanocytaires adultes pendant la phase anagène. Nous avons également défini les rôles critiques de BRG1 et BPTF en tant que cofacteurs de MITF et SOX10 dans le mélanome de souris in vivo. L'étude du rôle de la sous-unité ATPase CHD4 du complexe NuRD nous a conduit dans le domaine du métabolisme des cellules cancéreuses. Nous avons défini un nouveau mécanisme par lequel la citrullination de l'enzyme glycolytique clé PKM2 régule la glycolyse et la prolifération cellulaire dans une variété de cellules cancéreuses.
Une liste complete de publications se trouve ici: https://orcid.org/0000-0001-5533-1171
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Actualités
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Le mélanome est un cancer caractérisé par une dangerosité accrue en raison de sa croissance rapide et de sa propension à métastaser. Dans un article…
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Publications
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2015
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Structural Basis of Natural Promoter Recognition by the Retinoid X Nuclear Receptor
- Judit Osz
- Alastair McEwen
- Pierre Poussin-Courmontagne
- Emmanuel Moutier
- Catherine Birck
- Irwin Davidson
- Dino Moras
- Natacha Rochel
Scientific Reports ; Volume: 5 ; Page: 8216
-
Transcription factor MITF and remodeller BRG1 define chromatin organisation at regulatory elements in melanoma cells
- Patrick Laurette
- Thomas Strub
- Dana Koludrovic
- Céline Keime
- Stéphanie Le Gras
- H Seberg
- E van Otterloo
- H Imrichova
- R Siddaway
- S Aerts
- R Cornell
- Gabrielle Mengus
- Irwin Davidson
eLife ; Volume: 4
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Retinoic Acid Receptors Control Spermatogonia Cell-Fate and Induce Expression of the SALL4A Transcription Factor
- Aurore Gely-Pernot
- Mathilde Raverdeau
- Marius Teletin
- Nadege Vernet
- Betty Féret
- Muriel Klopfenstein
- Christine Dennefeld
- Irwin Davidson
- Gérard Benoit
- Manuel Mark
- Norbert B Ghyselinck
PLoS Genetics ; Volume: 11 ; Page: e1005501
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2014
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Regulatory and Functional Connection of Microphthalmia-Associated Transcription Factor and Anti-Metastatic Pigment Epithelium Derived Factor in Melanoma
- Asunción Fernández-Barral
- Jose Luis Orgaz
- Pablo Baquero
- Zaheer Ali
- Alberto Moreno
- María Tiana
- Valentí Gómez
- Erica Riveiro-Falkenbach
- Carmen Cañadas
- Sandra Zazo
- Corine Bertolotto
- Irwin Davidson
- Jose Luis Rodriguez-Peralto
- Ignacio Palmero
- Federico Rojo
- Lasse Dahl Jensen
- Luis del Peso
- Benilde Jiménez
Journal of Mammary Gland Biology and Neoplasia ; Volume: 16 ; Page: 529-542
-
SIRT1 promotes proliferation and inhibits the senescence-like phenotype in human melanoma cells
- Mickaël Ohanna
- Caroline Bonet
- Karine Bille
- Maryline Allegra
- Irwin Davidson
- Philippe Bahadoran
- Jean-Philippe Lacour
- Robert Ballotti
- Corine Bertolotto
Oncotarget ; Volume: 5 ; Page: 2085-95
-
Phosphorylation of the retinoic acid receptor RARgamma2 is crucial for the neuronal differentiation of mouse embryonic stem cells
- Ziad Al Tanoury
- Samia Gaouar
- Aleksandr Piskunov
- Tao Ye
- Sylvia Urban
- Bernard Jost
- Céline Keime
- Irwin Davidson
- Andrée Dierich
- Cécile Rochette-Egly
Journal of Cell Science ; Volume: 127 ; Page: 2095-2105
-
TAF4 Inactivation Reveals the 3 Dimensional Growth Promoting Activities of Collagen 6A3
- Igor Martianov
- Emilie Cler
- Isabelle Duluc
- Serge Vicaire
- Muriel Philipps
- Jean-Noël Freund
- Irwin Davidson
PLoS ONE ; Volume: 9 ; Page: e87365
-
TAF4, a subunit of transcription factor II D, directs promoter occupancy of nuclear receptor HNF4A during post-natal hepatocyte differentiation
- Daniil Alpern
- Diana Langer
- Benoit Ballester
- Stephanie Le Gras
- Christophe Romier
- Gabrielle Mengus
- Irwin Davidson
eLife ; Volume: 3 ; Page: 308-312
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-
2013
-
Sumoylation at chromatin governs coordinated repression of a transcriptional program essential for cell growth and proliferation
- Hélène Neyret-Kahn
- Moussa Benhamed
- Tao Ye
- Stéphanie Le Gras
- Jack-Christophe Cossec
- Pierre Lapaquette
- Oliver Bischof
- Maia Ouspenskaia
- Mary Dasso
- Jacob-Sebastian Seeler
- Irwin Davidson
- Anne Dejean
Genome Research ; Volume: 23 ; Page: 1563-1579
-
Trim24-repressed VL30 retrotransposons regulate gene expression by producing noncoding RNA
- Benjamin Herquel
- Khalid Ouararhni
- Igor Martianov
- Stéphanie Le Gras
- Tao Ye
- Céline Keime
- Thierry Lerouge
- Bernard Jost
- Florence Cammas
- Régine Losson
- Irwin Davidson
Nature Structural and Molecular Biology ; Volume: 20 ; Page: 339-346
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