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Actualités scientifiques

Des échantillons de plus en plus petits

Visualisation de liaisons de l'oestrogène sur différents loci (casp7 et TIFF1) issus de ChIP-seq. Les séquences immunomarquées ont été faites séparément à partir d'échantillons de 2 millions, 100 000, 10 000 et 5 000 cellules amplifiées (les 3 derniers grâce à la méthode LinDA).

Single-tube linear DNA amplification (LinDA) for robust ChIP-seq

Shankaranarayanan P., Mendoza-Parra M.A., Walia M., Wang L., Li N., Trindade L.M., Gronemeyer H.

Nat Methods 2011


6 juin 2011

L'équipe d'Hinrich Gronemeyer a récemment développé une méthode d'amplification linéaire simple tube (LinDA) pour ChIP-seq et reChIP-seq qui permet maintenant d'utiliser des échantillons d'ADN de l'ordre du picigramme. Ces échantillons pourront être obtenus à partir de quelques centaines de cellules seulement. Ces résultats sont publiés le 5 juin dans Nature Methods.

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