L'équipe
  • Chercheurs

    Stephan COLLINS

    Christel DEPIENNE

    Binnaz YALCIN

  • Doctorants

    Perrine KRETZ

  • Ingénieurs & Techniciens

    Marie-Christine FISCHER

    Christel WAGNER

  • Stagiaire

    Sebastian CISCARES VELAZQUEZ

Médecine translationnelle et neurogénétique

Base génétique des maladies cognitives

Les maladies cognitives représentent 5 à 10% des coûts de santé publique et sont parmi les maladies les plus souvent rencontrées dans les services de pédiatrie, neurologie et génétique médicale.

La déficience intellectuelle est la plus sévère et fréquente des maladies cognitives, et affecte 1 à 3% de la population générale pourtant, peu de choses sont encore connues sur les mécanismes sous-jacents impliqués dans ces maladies. Selon les estimations, la moitié des cas non diagnostiqués de déficience intellectuelle aurait une cause génétique. On suggère même que jusqu'à 2500 gènes supplémentaires pourraient être, dans les prochaines années, impliqués dans la déficience intellectuelle.

 

Un des objectifs principaux de nos études est d’identifier les gènes et les réseaux de gènes associés aux fonctions cognitives, en utilisant la souris comme modèle animal.

Par le biais d’une collaboration étroite avec le «International Knockout Mouse Consortium» (IKMC), dont le but est de créer et caractériser des lignées de souris knockout pour les 20’000 gènes du génome murin, nous analysons l’impact de tous ces gènes knockout sur l’anatomie cérébrale, de façon systématique et non biaisée. Nous nous impliquons également dans l’étude génétique du syndrome de micro-délétion 16p11.2, qui est le syndrome le plus fréquemment rencontré chez les patients autistiques, et se caractérise par un retard du développement et par des malformations cérébrales comme la macrocéphalie.

 

En parallèle à ces approches génétiques à haut débit, nous développons des approches fonctionnelles complémentaires, principalement axées sur la compréhension biologique des malformations cérébrales. Nous étudions plusieurs de ces gènes (Wdr47, Ino80e, Mapk3, Mvp, Doc2a, et Tbx6) avec, pour objectif, de déterminer leur fonction au niveau cérébrale, ainsi que les conséquences de leur inactivation sur l’organisme entier.

 

Ainsi, nous abordons ces questions dans un contexte multidisciplinaire, combinant la génétique humaine et celle de la souris, les approches génomiques à grande échelle et les études fonctionnelles, dans le but ultime de déchiffrer les causes génétiques des maladies cognitives associées à des malformations cérébrales et ainsi, améliorer le diagnostique clinique et le traitement des patients.

 

  • Projets en cours

  • Collaborations

  • Prix/Distinctions

    • Binnaz YALCIN - Chaire Gutenberg - Cercle Gutenberg / Région Alsace - 2015
  • Actualites

  • Publications

    • Copy Number Variations Found in Patients with a Corpus Callosum Abnormality and Intellectual Disability.

      Heide S(1), Keren B(2), Billette de Villemeur T(3), Chantot-Bastaraud S(4), Depienne C(5), Nava C(6), Mignot C(7), Jacquette A(7), Fonteneau E(2), Lejeune E(2), Mach C(2), Marey I(7), Whalen S(8), Lacombe D(9), Naudion S(9), Rooryck C(9), Toutain A(10), Caignec CL(11), Haye D(12), Olivier-Faivre L(13), Masurel-Paulet A(13), Thauvin-Robinet C(13), Lesne F(7), Faudet A(7), Ville D(14), des Portes V(14), Sanlaville D(15), Siffroi JP(4), Moutard ML(3), Heron D(16).

      J Pediatr 8 mars 2017 .

    • Genetic and phenotypic dissection of 1q43q44 microdeletion syndrome and neurodevelopmental phenotypes associated with mutations in ZBTB18 and HNRNPU.

      Depienne C(1,)(2,)(3,)(4,)(5), Nava C(6,)(7,)(8), Keren B(6,)(7), Heide S(7,)(9), Rastetter A(6), Passemard S(10,)(11,)(12), Chantot-Bastaraud S(13), Moutard ML(14,)(15,)(16), Agrawal PB(17), VanNoy G(17), Stoler JM(17), Amor DJ(18,)(19), Billette de Villemeur T(12,)(14,)(15,)(20), Doummar D(14,)(16), Alby C(21,)(22), Cormier-Daire V(23,)(22), Garel C(24), Marzin P(7), Scheidecker S(25), de Saint-Martin A(26,)(27), Hirsch E(26,)(28), Korff C(29), Bottani A(30), Faivre L(31,)(32), Verloes A(11), Orzechowski C(33), Burglen L(12,)(34,)(35), Leheup B(36), Roume J(37), Andrieux J(38), Sheth F(39), Datar C(40), Parker MJ(41), Pasquier L(42), Odent S(42,)(43,)(44), Naudion S(45), Delrue MA(45,)(46), Le Caignec C(47,)(48), Vincent M(47), Isidor B(47,)(48), Renaldo F(10,)(14), Stewart F(49), Toutain A(50), Koehler U(51), Hackl B(52), von Stulpnagel C(52), Kluger G(52,)(53), Mller RS(54,)(55,)(8), Pal D(56,)(8), Jonson T(57), Soller M(58), Verbeek NE(59), van Haelst MM(59), de Kovel C(59), Koeleman B(59,)(60,)(8), Monroe G(59,)(60), van Haaften G(59,)(60); DDD Study, Attie-Bitach T(21,)(22), Boutaud L(21,)(22), Heron D(7,)(9,)(20), Mignot C(61,)(62,)(63,)(64).

      Hum Genet Apr 2017 ; 136:463-479 .

    • Mutations in DCC cause isolated agenesis of the corpus callosum with incomplete penetrance.

      Marsh AP(1,)(2), Heron D(3,)(4,)(5), Edwards TJ(6,)(7), Quartier A(8), Galea C(9), Nava C(3,)(10), Rastetter A(10), Moutard ML(11,)(12,)(13), Anderson V(14), Bitoun P(15), Bunt J(6), Faudet A(3), Garel C(16), Gillies G(1), Gobius I(6), Guegan J(17), Heide S(3,)(4), Keren B(3,)(10), Lesne F(3), Lukic V(18), Mandelstam SA(2,)(19,)(20), McGillivray G(21), McIlroy A(14), Meneret A(10,)(22), Mignot C(3,)(4,)(5), Morcom LR(6), Odent S(23,)(24), Paolino A(6), Pope K(1), Riant F(25), Robinson GA(26), Spencer-Smith M(14,)(27), Srour M(28,)(29), Stephenson SE(1,)(2), Tankard R(30,)(31), Trouillard O(10), Welniarz Q(10,)(32), Wood A(14,)(33), Brice A(3,)(10), Rouleau G(29,)(34), Attie-Bitach T(35,)(36), Delatycki MB(1,)(2,)(37), Mandel JL(8,)(38), Amor DJ(1,)(2), Roze E(10,)(22), Piton A(8,)(38), Bahlo M(30,)(31), Billette de Villemeur T(5,)(11,)(12,)(39), Sherr EH(40), Leventer RJ(2,)(41,)(42), Richards LJ(6,)(43), Lockhart PJ(1,)(2), Depienne C(3,)(8,)(10,)(38).

      Nat Genet 27 février 2017 .

    • Congenital Mirror Movements Due to RAD51: Cosegregation with a Nonsense Mutation in a Norwegian Pedigree and Review of the Literature.

      Oriane Trouillard, Jeanette Koht, Thorsten Gerstner, Siri Moland, Christel Depienne, Isabelle Dusart, Aure´lie Meneret,Marta Ruiz, Caroline Dubacq & Emmanuel Roze

      Tremor and Other Hyperkinetic Movements november 2016 2016 ; 3:424 .

    • Histomorphological Phenotyping of the Adult Mouse Brain.

      Mikhaleva A(1), Kannan M(1,)(2,)(3,)(4,)(5), Wagner C(2,)(3,)(4,)(5), Yalcin B(1,)(2,)(3,)(4,)(5).

      Curr Protoc Mouse Biol 1 septembre 2016 ; 6:307-32 .

    • Increased Expression of the Diabetes Gene SOX4 Reduces Insulin Secretion by Impaired Fusion Pore Expansion.

      Collins SC(1), Do HW(2), Hastoy B(2), Hugill A(3), Adam J(2), Chibalina MV(2), Galvanovskis J(4), Godazgar M(2), Lee S(5), Goldsworthy M(3), Salehi A(6), Tarasov AI(7), Rosengren AH(8), Cox R(3), Rorsman P(9).

      Diabetes Jul 2016 ; 65:1952-61 .

    • Identification of structural variation in mouse genomes.

      Keane TM(1), Wong K(1), Adams DJ(1), Flint J(2), Reymond A(3), Yalcin B(4).

      Front Genet 2 juillet 2014 ; 5:192 .

    • Genome-wide generation and systematic phenotyping of knockout mice reveals new roles for many genes.

      White JK(1), Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC; Sanger Institute Mouse Genetics Project, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP.

      Cell 18 juillet 2013 ; 154:452-64 .

    • A comparative phenotypic and genomic analysis of C57BL/6J and C57BL/6N mouse strains.

      Simon MM, Greenaway S, White JK, Fuchs H, Gailus-Durner V, Wells S, Sorg T, Wong K, Bedu E, Cartwright EJ, Dacquin R, Djebali S, Estabel J, Graw J, Ingham NJ, Jackson IJ, Lengeling A, Mandillo S, Marvel J, Meziane H, Preitner F, Puk O, Roux M, Adams DJ, Atkins S, Ayadi A, Becker L, Blake A, Brooker D, Cater H, Champy MF, Combe R, Danecek P, di Fenza A, Gates H, Gerdin AK, Golini E, Hancock JM, Hans W, Holter SM, Hough T, Jurdic P, Keane TM, Morgan H, Muller W, Neff F, Nicholson G, Pasche B, Roberson LA, Rozman J, Sanderson M, Santos L, Selloum M, Shannon C, Southwell A, Tocchini-Valentini GP, Vancollie VE, Westerberg H, Wurst W, Zi M, Yalcin B, Ramirez-Solis R, Steel KP, Mallon AM, de Angelis MH, Herault Y, Brown SD.

      Genome Biol 31 juillet 2013 ; 14:R82 .

    • Next-generation sequencing of experimental mouse strains.

      Yalcin B(1), Adams DJ, Flint J, Keane TM.

      Mamm Genome Oct 2012 ; 23:490-8 .

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